当绿灯闪烁变黄灯时，如果车辆已经越过停止线但还未越过路口，这不算闯红灯，而是越线停车。根据最新的交通法规标准，如果车辆在红灯亮起时已经越过了停止线，但立即停住了，这种情况不会被处罚。然而，如果在越线停车后还有明显的位置移动，那就可能会被处罚。因此，当绿灯闪烁变黄灯时，车辆被堵在路中间，如果未越过路口并且立即停住，通常不会被视为违章。但为了避免可能的交通违法行为，建议在绿灯闪烁时减速停车。