羊肚菌杂菌主要分为以下几种：

细菌：包括枯草杆菌粘液变种、蜡状芽孢杆菌粘液变种等，这些细菌繁殖迅速，会产生异味并使菌丝酸败。

放线菌：以链霉菌为主，包括白色链霉菌、湿链霉菌等，它们会在培养基中或表面形成白色粉状斑点，产生土腥味，导致羊肚菌菌丝不长或消失。

酵母菌：包括红酵母、橙色红酵母、黑酵母等，这些酵母菌对羊肚菌的菌丝体危害很大，可能导致菌丝不长或死亡。

霉菌：羊肚菌的菌丝最容易受到霉菌的危害，常见的霉菌有白边青霉、白青霉、木霉等，它们会侵害羊肚菌的菌丝体，导致菌丝死亡或产量下降。

除了以上四种杂菌外，还可能存在其他杂菌，如小杆线虫、菇蚊、螨类等，它们也会对羊肚菌的生长和产量造成一定的影响。

为了防治这些杂菌，可以采取一系列措施，如选择适当的培养基配方、控制培养基的pH值、保持适宜的温度和湿度、加强通风换气、使用生物防治剂等。同时，定期检查菌丝的生长情况，及时发现并处理杂菌污染，也是保证羊肚菌产量和质量的重要措施之一。