广州南站的进站口在东边和西边都有一个进出站口，广州南站的进站口有两个地方,一个是车站的第一层、另外一个是在第三层。一层的1-14检票口离东进站口较近,15-18检票口离西进站口较近。三层是高架候车层,是旅客安检、进站候车和休息购物的主要区域。