肌原蛋白提取需要选择适宜的筛选方法。常用的提取方法为胰蛋白消化法，即将肌肉样品加入含有胰酶的缓冲液中，在离心、过滤、冷沉淀和酸沉淀后得到纯化的肌原蛋白。

此外还可使用离体肌切片谷氨酰转移酶方法，利用高速转动离心离析的技术，从细胞中分离并纯化肌原蛋白。肌原蛋白提取的成功与否与实验方法、样品类型、所采用的材料等有关，需综合考虑多种因素来选择提取方案。