占用应急车道被别的车主拍了可以申诉，但这并不意味着申诉一定会成功。根据《道路交通安全法》及其实施条例，应急车道主要供警车、消防车、工程救险车在执行任务或处理事故时使用，或在紧急情况下供其他车辆使用。因此，非紧急情况下，驶入应急车道是违法的。

不过，根据《道路交通安全违法行为处理程序规定》第21条第3款，如果有证据证明是救助危难或者紧急避险造成的违法行为，交警应当消除。这意味着，如果占用应急车道是为了救助危难或紧急避险，那么车主可以向交警部门提出申诉，并提供相关证据。

此外，根据《中华人民共和国行政复议法》第九条规定，公民、法人或者其他组织认为具体行政行为侵犯其合法权益的，可以自知道该具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。

因此，如果车主认为自己的行为是合法的，或者由于某种原因被误拍，可以向交警部门或相关政府部门提出申诉，并提供相关证据。但请注意，申诉并不一定会成功，具体结果还需由相关部门根据事实和证据进行判断。