是的，外汇申报可以分开申报。具体来说，一笔外汇款项如果包含两种不同的交易性质，可以填写一个申报单，同时在附言中将两种不同性质的内容分开填报。这样可以确保每笔交易的性质和金额都准确无误地进行申报。因此，在进行外汇申报时，根据具体情况可以选择分开申报的方式。