不会。补票只是为了补齐原本已经失效的车票，不会影响学生证次数的使用。学生证次数是与学生身份相关的，与车票的补票无关。因此，学生可以放心地进行补票，不必担心会浪费学生证次数。但要注意及时补票，避免因忘记补票而造成额外的费用和不便。