叠氮结构不稳定的原因主要有以下几个方面：

键能问题：叠氮基中的氮氮三键键能较小，容易断裂，导致叠氮结构不稳定。

共振效应：叠氮结构中的氮氮三键具有一定程度的双键性质，会产生共振，使叠氮结构更加不稳定。

电子效应：叠氮基中的负电荷分布不均，容易产生电子转移，导致叠氮结构不稳定。

空间效应：叠氮基中的三个氮原子处于同一平面上，相互排斥，使得叠氮结构不稳定。

因此，在设计和合成含有叠氮基的化合物时，需要注意这些因素，采取措施提高化合物的稳定性。