您好，棚改房款买新房拿产权证交税的计算方式和一般的房屋交易相同，具体需要考虑以下因素：

1.新房的总价：新房的总价包括房屋本身的价格、装修费用等。

2.原棚改房的购买价格：如果原棚改房的购买价格低于新房的总价，那么需要按照原棚改房的价格计算差价部分的交税。

3.房屋所在地的税率：房屋所在地的税率不同，交税的金额也会有所不同。

4.个人所得税：如果卖方是个人，还需要考虑个人所得税的问题。

综上所述，棚改房款买新房拿产权证交税的计算方式比较复杂，需要结合具体情况进行计算。建议咨询当地的房地产交易中心或相关税务机构，以确保交税的准确性。