医师自行卖药的利润与医师的诊所规模、药品种类、药品进价等因素有关。一般来说，医师自行销售药品的毛利率是比较高的，可以获得药品进价和售价的差价，因此其利润也是比较可观的。但是，医师自行销售药品也存在一定的不合规风险，并不是所有医生都会从中获得高额的利润。

此外，医师自行销售药品也可能引发药源紧缺、导致患者无法获得相应药品等一系列问题，因此医疗机构应该依法依规进行管理，维护医疗市场的公平与健康。