一是生物类型，马拉色菌是具有真核和细胞壁的生物，酵母菌是属于原核型细胞的一种单胞生物。

二是结构不同，马拉色菌细胞壁的主要成分是肽聚糖，而酵母菌细胞壁的主要成分是几丁质。