司法鉴定公司资质办理的流程包括了材料准备、申请提交、审核审批、颁发证书等多个环节。

首先，申请人需要向相关部门提交鉴定资料，如公司注册证明、鉴定人员资格证书等文件。然后由相关部门对材料进行审核审批，审核通过后颁发资质证书。

整个流程需要申请人认真准备材料，与相关部门紧密沟通，积极配合审核审批过程。