如果员工在工作中发生交通事故，导致工伤，医药费应该由用人单位承担。因为这是在工作过程中发生的意外伤害，属于工伤范畴。用人单位应当按照国家规定参加工伤保险，为本单位全部职工缴纳工伤保险费。

如果用人单位未按时缴纳工伤保险费，发生工伤的，由用人单位支付工伤保险待遇。因此，员工的医疗费用应由用人单位承担，而不是由员工自己承担。