vivo X100 Pro的16GB+512GB版本和12GB+256GB版本的主要区别体现在运行内存和存储空间上。

运行内存（RAM）：16GB+512GB版本的vivo X100 Pro配备了16GB的运行内存，而12GB+256GB版本则配备了12GB的运行内存。运行内存的大小会直接影响到手机的运行速度和多任务处理能力。一般来说，运行内存越大，手机处理复杂任务和多任务操作的能力就越强，运行也更加流畅。

存储空间（ROM）：在存储空间方面，16GB+512GB版本的vivo X100 Pro提供了512GB的存储空间，而12GB+256GB版本则提供了256GB的存储空间。存储空间的大小决定了用户可以在手机上保存多少数据，包括应用、照片、视频等。对于需要存储大量数据或经常拍摄高清视频和照片的用户来说，更大的存储空间显然更为实用。

除了运行内存和存储空间的区别外，这两个版本的vivo X100 Pro在其他方面，如处理器、摄像头、电池等配置应该是相同的。因此，用户在选择时可以根据自己的需求和预算来权衡。如果注重手机的运行速度和多任务处理能力，或者经常需要处理大型应用和数据，那么16GB+512GB版本可能更适合；而如果存储空间需求不大，或者预算有限，那么12GB+256GB版本也是一个不错的选择。