苏州灵活就业医保参保后的缴费时间主要取决于办理新增申报的时间。

具体来说，如果参保人在每月25日（含当日）之前办理新增申报，那么就可以从当月开始缴纳医疗保险费。而税务部门会在每月21日至26日期间进行批量扣款。

此外，如果参保人在每月20日（含当日）之前办理灵活就业中断业务，那么默认当月不缴费。

因此，建议参保人在办理新增申报后，及时关注自己的扣款账户，确保在扣款日前存有足够的余额以支付医疗保险费。同时，也要注意及时办理停保手续，避免不必要的缴费。