首先在清理小鱼粪便之前，需要将过多的鱼食减少，以控制小鱼的粪便量。清理时可以选择一个细密的网筛，将鱼粪筛出，也可选择专用的水族箱清洁器具，将底部杂质与鱼粪一并清除。

此外，定期更换水体，确保水质清洁，也是有效的清理方法。

清理结束后，应及时添加活性炭等的水质处理剂，以维持水体中适宜鱼类生存的水质。总的来说，控制饵料量、定期更换水质与使用专业的清洁器具是最佳的小鱼粪便清理方法。