房屋玻璃天窗漏水的维修费用因不同的情况而异，包括漏水程度、修复方法、窗户尺寸和材料类型等因素。一般情况下，修理费用大约在1000元到5000元之间。如果只是表面问题，如密封剂老化或破裂，费用较低。但如果需要更换零部件，费用将更高。建议及时维修，以避免因水患引起的更大的损失。