盆栽番茄发芽后，移栽的最佳时间是在幼苗长出两片真叶后。

原因是在幼苗长出两片真叶后，它的根系已经发育良好，能够更好地适应新的生长环境。

此时移栽可以促进幼苗的生长和发育，有利于植株的健壮生长。

在移栽番茄幼苗时，需要选择适宜的盆土和盆器，保证良好的排水性和通气性。

移栽后，还需要注意给予足够的阳光照射和适量的水分供应，以及适当的施肥和定期修剪，以促进番茄植株的生长和结果。

同时，也要注意防治病虫害，保持植株的健康。