秀英港之所以要两小时过海，主要是受到以下三个因素的影响：

首先，秀英港与深圳港的距离较远，需要船只在较长时间内穿越大海，才能抵达对岸。

其次，船只在海上航行需要考虑潮汐和海浪等自然因素的影响，这也会加长渡船的航行时间。

最后，为了保证渡轮的航行安全以及在海上的通航和其他交通工具进行协调，还需要遵守一系列的航海规定和程序，这也会增加渡船过海的时间。