农村自建房的层高通常是指从房屋的楼板表面到楼板表面的垂直距离。按照规定10米的层高，那么这个层高就是从一楼楼板表面到二楼楼板表面的垂直距离。在计算楼层面积时，需要将层高乘以楼板的平面面积。例如，如果楼板平面面积是20平方米，那么这个楼层的建筑面积就是20平方米×10米=200平方米。