商标部如果对申请人的商标分类目提出驳回，其实并不一定会退费。退费与驳回的具体原因和情况有关，如果是因为申请人提交的材料缺失或不符合规定导致的驳回，一般是不会退费的。

但如果是因为商标部认为申请人的商标与已有商标过于相似，或者商标涉及的专用名称或公共词汇等原因导致的驳回，可能会退回商标注册费用。因此，申请人在申请商标时，应认真阅读相关规定，确保提交完整和规范的材料，避免不必要的损失和误解。