区别是用途不一样。

包机指根据公共航空运输企业与包机人所签订的包机合同而进行的点与点之间的不定期飞行，包括普通包机飞行、专机飞行、急救包机飞行、旅游包机飞行等。

专机是指为某人、某事特别飞行的飞机，或某人专用的飞机。特指的就是各国国家元首或领导人物访问别国时，乘坐的飞机。在中国，领导人提倡勤俭节约，不仅专机设施、配备保持着朴素风格，并且从严格意义上讲，国家领导人的专机是由普通民航客机“客串”的。