新农合在市级三甲医院报销比例是65%左右。

新农合报销比例与就诊机构有关，就诊机构级别越高报销比例越低，一般新农合三甲医院报销的比例在65%左右，不过，还需以当地医保报销政策与就诊机构的报销政策为准。