隋唐遗址植物园共有两个出口，分别位于东侧和南侧。东侧出口靠近文昌阁，可直接通往园内的游客中心和停车场，是游客常用的出口之一。南侧出口则位于园区的最南端，靠近慈恩寺遗址，出口沿路有多个景点，如景湖、相思桥等。无论从哪个出口离开，游客都能够欣赏到植物园内的美丽景色，并顺利离开园区。同时，植物园还设有多个警示牌和地图，以方便游客找到出口并更好地探索园区。