鉴别一只边境牧羊犬幼崽的方法比较多，主要从以下几个方面进行观察和比较：

1. 头型：边境牧羊犬幼犬的头型较小而且比身体要小，与成年犬相比更显得圆润。

2. 面部表情：边境牧羊犬幼犬具有和成年犬一样的独特面部表情，但是，幼犬的表情显得更为单纯可爱。

3. 尾巴：幼犬的尾巴较短，同时尾巴的颜色较身体浅。

4. 毛发颜色：边境牧羊犬幼犬在出生时毛色较黑，一个月左右毛发颜色会变浅。

5. 体型：边境牧羊犬幼犬体型较小，但是要比其他犬种的幼犬显得更加古怪，因为他们的肢体看起来强壮而且很长，在其他狗狗中较为明显。