山东人的基因主要来自于山西人，明朝时期山西人口众多，曾大规模迁移到山东。

据考证中原汉族文化主要起源于山西的丁村文化、河南的仰韶文化、山东的大汶口文化，山西、河南、陕西、山东是古中原汉人保留较多的地区，也有部分为汉人与鲜卑、匈奴、女真混血后裔。