工业厂房流程走完了，不动产证也办好了，但房管局不给的原因可能有多种。一种可能是该厂房存在违规建设或者不符合相关规定，例如擅自改变规划用途、超面积开发违法建设等，导致规划无法验收，因此房管局不给予办理产权证。另一种可能是该厂房的土地使用权存在问题，例如土地存在抵押或查封等情况，导致房管局无法办理产权证。此外，也有可能是房管局内部存在一些问题，例如审批流程繁琐、人员不足等导致办理进度缓慢。

针对这种情况，建议您可以先了解具体原因，与房管局进行沟通协商，尽快解决问题。如果确实存在违规建设等问题，需要积极配合相关部门进行整改，以便尽快取得产权证。