荣耀Magic 6 Pro的小圆点可以通过以下步骤进行设置：

首先，进入手机“设置”界面，然后点击“屏幕与亮度”选项，在下拉界面中点击“指示器与操作区域”，找到“屏幕底部导航栏”选项，在其中选择“小圆点”选项，然后开启就可以了。

开启后，可以通过长按、双击等手势来进行不同的操作，如返回桌面、启动任务管理器等。小圆点功能的设置可以让用户更加便捷地使用手机，提高使用体验。