承认。

中国医学科学院颁发的针灸证书是合法合规的，中国医学科学院是我国卫生健康部门直属的综合性医学科学研究机构，具有一定的权威性和公信力，中国医学科学院开展的针灸培训和发放的针灸证书应该是符合法律法规的，并且具有一定的合法性。法律依据：中科院针灸师证是国家承认的。