根据提供的信息，宝通寺在历史上经历了多次修复。其中，明朝初年，宝通寺再度重修与扩建。明宪宗成化二十一年（1485年），崇宁万寿禅寺被策为宝通禅寺，沿袭至今。1953年，政府拨款维修宝塔及备殿堂，培植园林花卉，使其恢复旧观，并列为国家文物保护单位。此外，1983年，宝通寺被国务院确定为汉族地区佛教全国重点寺院，并被列为全国汉传佛教重点开放寺院。1992年，宝通寺被列为湖北省文物保护单位。这些修复工作有助于保护和传承宝通寺的历史文化遗产。