清洗卫生间热水器的步骤如下：

关掉电源和水，将热水器里面的水全部排放干净。

拆洗，将热水器的镁棒拿出来清洗一下，不能用粗糙的工具洗刷，容易把镁棒外表的涂层刮掉，影响加热效果，冲洗干净之后再安装回去。

利用热水器两个不同的水管来清洗，先将花洒等配件拆下来，一头安装在水龙头上，另一个管道用来排水，利用水的冲击力将热水器清洗干净，再重复几遍以上操作，直到从排污口流出的水已经干净清澈。

检查各个接头处是否有渗漏，如果有渗漏需重新连接，确保各连接处无渗漏。

插上电热水器的插头，开启电源，检查加热情况，一切正常后，清洗工作就全部完成了。